Programme d’études 2020-2021 | English | ||
Science des données II : analyse et modélisation | |||
Unité d’enseignement du programme de Bachelier en sciences biologiques à la Faculté des Sciences |
Les étudiants sont invités à consulter les fiches ECTS des AA pour prendre connaissance des modalités d’évaluation spéciales Covid-19 éventuellement prévues pour la fin du Q3 |
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Code | Type | Responsable | Coordonnées du service | Enseignant(s) |
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US-B3-SCBIOL-006-M | UE Obligatoire | GROSJEAN Philippe | S807 - Ecologie numérique |
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Langue d’enseignement | Langue d’évaluation | HT(*) | HTPE(*) | HTPS(*) | HR(*) | HD(*) | Crédits | Pondération | Période d’enseignement |
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| Français | 0 | 40 | 0 | 0 | 0 | 3 | 3.00 | Année |
Code(s) d’AA | Activité(s) d’apprentissage (AA) | HT(*) | HTPE(*) | HTPS(*) | HR(*) | HD(*) | Période d’enseignement | Pondération |
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S-BIOG-015 | Sciences de données II : modélisation | 0 | 20 | 0 | 0 | 0 | Q1 | |
S-BIOG-061 | Science des données II : analyse | 0 | 20 | 0 | 0 | 0 | Q2 |
Unité d'enseignement |
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Objectifs par rapport aux acquis d'apprentissage du programme
Acquis d'apprentissage UE
Etre capable d'analyser correctement des données biologiques variées. En particuliers, les différentes modèles linéaires (modèle linéaire, modèle linéaire généralisé, modèles non-linéaire,...), les méthodes d'ordination (ACP et AFC) et de classification (dendrogramme) sont étudiés. Apprendre à décrire correctement les données, et à tester les conditions d'application des techniques envisagées. Apprendre également à tirer des conclusions appropriées par rapport à l'analyse effectuée, et à les formuler de manière rigoureuse. Nous insistons également sur la présentation des résultats (rédaction de rapports) et sur l'utilisation de logiciels professionnels dans le domaine de la science des données : R, RStudio, R Markdown, git.
Contenu de l'UE
Les chapitres de cette UE sont:
- Modèle linéaire
- Modèle linéaire, outils diagnostics
- Modèle linéaire généralisé
- Modèle non linéaire
- Distances et classification hiérarchique
- K-means, MDS et SOM
- ACP et AFC
- AFM et indices de biodiversité
Compétences préalables
Bases en science des données, en particulier, la gestion de projets d'analyse des données, l'importation et le remaniement des données, la visualisation à l'aide de graphiques et la rédaction de rapports reproductibles. Statistiques uni- et bivariées de base, y compris ANOVA, variance, covariance et corrélation. Utilisation des logiciels R, RStudio, R Markdown et git.
Types d'évaluations Q1 pour l'UE
Commentaire sur les évaluations Q1 de l'UE
Note globale rassemblant les évaluations suivantes:
- Evaluation de la progression en continu
- Participation lors des classes renversées
- Réalisations aux travaux pratiques
- Rapport d'analyse de données coté
- eTest
En raison de l'évaluation de la progression en continu, la présence aux séances est obligatoire.
Types d'évaluations Q2 pour l'UE
Commentaire sur les évaluations Q2 de l'UE
Note globale rassemblant les évaluations suivantes:
- Evaluation de la progression en continu
- Participation lors des classes renversées
- Réalisations aux travaux pratiques
- Rapport d'analyse de données coté
- eTest
En raison de l'évaluation de la progression en continu, la présence aux séances est obligatoire.
Types d'évaluation Q3 pour l'UE
Commentaire sur les évaluations Q3 de l'UE
Similaire à Q1 & Q2.
Types d'évaluation rattrapage BAB1 (Q1) pour l'UE
Commentaire sur les évaluations rattr. Q1 de l'UE
Pas applicable.
Types d'activités
AA | Types d'activités |
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S-BIOG-015 |
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S-BIOG-061 |
|
Mode d'enseignement
AA | Mode d'enseignement |
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S-BIOG-015 |
|
S-BIOG-061 |
|
Supports principaux
AA | |
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S-BIOG-015 | |
S-BIOG-061 |
Supports principaux non reproductibles
AA | Supports principaux non reproductibles |
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S-BIOG-015 | Sans objet |
S-BIOG-061 | Sans objet |
Supports complémentaires
AA | |
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S-BIOG-015 | |
S-BIOG-061 |
Supports complémentaires non reproductibles
AA | Support complémentaires non reproductibles |
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S-BIOG-015 | Pas applicable. |
S-BIOG-061 | Sans objet |
Autres références conseillées
AA | Autres références conseillées |
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S-BIOG-015 | Barnier, J., 2018. Introduction à R et au tidyverse (https://juba.github.io/tidyverse/index.html). Ismay, Ch. & Kim A.Y, 2018. Moderndive: An introduction to statistical and data science via R (http://moderndive.com). Wickham, H. & Grolemund, G, 2017. R for data science (http://r4ds.had.co.nz). Zar, J.H., 2010. Biostatistical analysis (5th ed.). Pearson Education, London. 944pp. Husson, F., S. Lê & J. Pagès, 2009. Analyse de données avec R. Presses universitaires de Rennes, Rennes. 224pp. Cornillon, P.A. Et al, 2008. Statistiques avec R. Presses Universitaires de Rennes. 257pp. Dagnelie, P., 2007. Statistique théorique et appliquée, Volumes I et II (2ème ed.). De Boeck & Larcier, Bruxelles. 511pp (vol. I) 734pp (vol. II). |
S-BIOG-061 | Barnier, J., 2018. Introduction à R et au tidyverse (https://juba.github.io/tidyverse/index.html). Ismay, Ch. & Kim A.Y, 2018. Moderndive: An introduction to statistical and data science via R (http://moderndive.com). Wickham, H. & Grolemund, G, 2017. R for data science (http://r4ds.had.co.nz). Zar, J.H., 2010. Biostatistical analysis (5th ed.). Pearson Education, London. 944pp. Husson, F., S. Lê & J. Pagès, 2009. Analyse de données avec R. Presses universitaires de Rennes, Rennes. 224pp. Cornillon, P.A. Et al, 2008. Statistiques avec R. Presses Universitaires de Rennes. 257pp. Dagnelie, P., 2007. Statistique théorique et appliquée, Volumes I et II (2ème ed.). De Boeck & Larcier, Bruxelles. 511pp (vol. I) 734pp (vol. II). Sans objet |