Objectifs par rapport aux acquis d'apprentissage du programme

• Comprendre, décrire, analyser et hiérarchiser les phénomènes biologiques.
• Maîtriser des connaissances scientifiques de base et être capable de les exploiter.
• Résoudre des problèmes.
• Maîtriser les approches moléculaires, morphologiques et fonctionnelles des états normaux et pathologiques.
• Pouvoir intégrer les notions issues de différentes approches/disciplines dans un problème biomédical complexe.
• Pouvoir expliquer comment les modifications moléculaires, morphologiques et fonctionnelles engendrent les états pathologiques et inversement.
• Avoir développé une aptitude au raisonnement
• Travailler avec efficience/exactitude/précision.
• Pouvoir poser une hypothèse et un raisonnement hypothético-déductif.
• Développer un esprit critique, savoir tester et contrôler ses conclusions, en connaître le domaine de validité, envisager des hypothèses alternatives.
• Démontrer une capacité relationnelle développée.
• Pouvoir utiliser un vocabulaire riche reliant avec précision les concepts et les mots.
• Pouvoir synthétiser, expliciter, argumenter.
• Pouvoir présenter des examens, des rapports et des communications orales.
• Etre capable de gérer les ressources
• Pouvoir gérer son temps.
• Pouvoir établir des priorités.
• Gérer sa formation
• Etre capable d'auto-évaluation et de rétroaction.

Acquis d'apprentissage de l'UE

Au terme de l'enseignement, l'étudiant.e aura acquis des notions de base en microbiologie médicale et en diagnostic biologique des infections humaines causées par des parasites, y compris les protozoaires, les helminthes et les arthropodes et par des champignons dont des levures et filamenteux.

Les objectifs du cours sont de
1) Connaître les principaux parasites susceptibles d'infecter l'homme, leurs caractéristiques biologiques, les aspects cliniques des infections associées et leur importance épidémiologique.
2) Comprendre les relations de ces microorganismes avec l'homme (écologie microbienne, vecteurs, mécanismes de colonisation/invasion, pouvoir pathogène et virulence, évasion des défenses de l'hôte).
3) Connaître les modes de transmission des pathogènes à l'homme et comprendre les stratégies de maîtrise et de prévention des infections
4) Connaître les principales méthodes de diagnostic des parasites et comprendre leurs limites et leur hiérarchie d'utilisation
5) Connaître les principaux groupes de médicaments antiparasitaires et antimycotiques, leurs principes d'action, les mécanismes de résistance des microorganismes, l'épidémiologie de la résistance et comprendre les stratégies d'utilisation rationnelle de ces médicaments pour le traitement et la prévention

Contenu de l'UE : descriptif et cohérence pédagogique

Le cours sera divisé en deux modules comprenant la parasitologie et la mycologie.

Les thèmes suivants seront développés spécifiquement dans le module de parasitologie : 1ère partie introduction générale: les caractéristiques générales des parasites (définitions, classifications), les vecteurs, leurs pouvoirs pathogènes, les bases fondamentale des traitements et des prophylaxies antiparasitaires et le diagnostic des infections parasitaires au laboratoire. 2ème partie parasitologie spéciale: Cette partie du cours abordera de manière plus spécifique les différentes pathologies associées aux principaux protozoaires (digestifs, urogénitaux, sanguins et tissulaires), helminthes (nématodes, cestodes et trématodes) et arthropodes (pathogènes, vecteurs) responsables d'infections chez l'homme avec leur cycle de développement, leurs pathologies associées, leur épidémiologie et leur approche diagnostic et thérapeutique. Des chapitres se consacreront spécifiquement sur la lutte contre les maladies vectorielles et la lutte contre les géohelminthes. 3ème partie agents antiparasitaires: Cette dernière partie décrira brièvement les principaux agents antiparasitaires, leurs mécanismes d'action.
Les thèmes suivants seront développés spécifiquement dans le module de mycologie : 1ère partie : les caractéristiques générales des champignons (définition, morphologie, métabolisme), les bases fondamentale des traitements antimycotiques et le diagnostic des infections au laboratoire de mycologie 2ème partie : Les principales infections fungiques dont les mycoses cutanées (dermatophytes), opportunistes (aspergillose, candidose, pneumocystose...) et dimorphiques (histoplasmose, ...) seront détaillées avec leurs aspects cliniques, épidémiologiques et thérapeutiques. 3ème partie agents antimycotiques: Cette dernière partie décrira brièvement les principaux agents antifongiques (échinocandines, azolés et polyènes), leur(s) mécanisme(s) d'action.

Compétences préalables

Notion de biologie et de microbiologie générale