Objectifs par rapport aux acquis d'apprentissage du programme

• Compétences scientifiques
• Utiliser des logiciels d'acquisition et d'analyse de données propres aux sciences biomédicales
• S'approprier les outils d'étude en sciences biomédicales y compris les outils bio-informatiques
• Maîtriser les outils statistiques pour les sciences du vivant
• Être un chercheur responsable: - Savoir baser son raisonnement sur les données de la littérature scientifique- Savoir intégrer une dimension éthique dans son raisonnement- Faire preuve de loyauté (aux faits, à l'équipe, à la propriété intellectuelle,...)- Ne pas falsifier les résultats- Ne pas exploiter le travail d'autrui- Faire preuve de rigueur expérimentale
• Compétences d'intégration professionnelle
• Travailler en réseau, utiliser les outils numériques de communication et de travail collaboratif
• Être responsable, à l'ère du numérique, de la maitrise de son identité numérique, respecter la réglementation en matière de vie privée et de propriété intellectuelle
• Être autonome dans le travail: - S'organiser individuellement, gérer son temps et ses priorités, s'autoévaluer- Maîtriser les méthodes d'évaluation- Poursuivre par soi-même ses apprentissages, se préparer à se former tout au long de la vie- Faire preuve de capacité d'abstraction- Être initié à la gestion de projets- Faire preuve d'initiative
• Faire preuve de capacités de recherche d'informations, d'analyse et de synthèse:- Rechercher, analyser, exploiter des informations de sources et supports différents en relation avec les sciences biomédicales, les mettre en forme en vue de préparer un document synthétique, les produire et les diffuser sur des supports numériques- Réaliser une étude, identifier et poser une problématique dans un contexte prédéfini, construire et développer une argumentation, interpréter les données et les résultats, élaborer une synthèse, proposer des prolongements- Se remettre en question, faire preuve d'esprit critique, débattre, controverser et/ou défendre ses idées
• Maîtriser l'expression scientifique écrite et orale. Être autonome dans l'activité d'écriture et montrer à cette occasion sa capacité à communiquer sa pensée, à raisonner et à organiser ses connaissances
• Construire et illustrer un exposé adapté à l'objet, aux circonstances et au public: prendre la parole en public
• Maîtriser l'anglais scientifique:- Être capable de présenter ses résultats scientifiques oralement et par écrit en anglais- Être capable de répondre à des questions scientifiques en anglais

Acquis d'apprentissage UE

A partir d'un article scientifique commun, l'objectif est de montrer aux étudiants l'intégration des données issues des méthodes d'analyse utilisées en génomique, transcriptomique, protéomique, et métabonomique.  A l'issue de ce cours, les étudiants seront capables de :

- comprendre l'importance d'intégrer les données de plusieurs sciences "omiques" dans l'étude d'un mécanisme biologique complexe
- intégrer et interpréter des données de type 'omique"
- décrire les concepts et méthodes utilisées lors de l'acquisition des données 'omiques'

Contenu de l'UE

1. <u><strong>Partie Métabonomique</strong></u> (Professeur Jean-Marie Colet):

- étapes d'une étude métabonomique
- analyse de biofluides par Résonance Magnétique Nucléaire du proton
- analyse multivariée des spectres

2.<strong><u> Partie Protéomique </u></strong>: (Professeur Rudy Wattiez)

- rappel sur la spectrométrie de masse
- étapes d'une étude protéomique

3.<strong> <u>Partie Génomique/Transcriptomique</u> </strong>: (Professeur Alexandra Belayew)
 
- biopuces: analyses d'ADN et d'ARN
- séquençage à haut débit

Compétences préalables

notions fondamentales en biologie moléculaire
principes et méthodes spectroscopiques
bases statistiques

Types d'évaluation Q1 pour l'épreuve intégrée

• Présentation et travaux
• Examen oral

Types d'évaluation Q2 pour l'épreuve intégrée

• Présentation et travaux
• Examen oral

Types d'évaluation du Q3 pour l'épreuve intégrée

• Présentation et travaux
• Examen oral