Programme d’études 2021-2022English
Algorithmique et bioinformatique
Unité d’enseignement du programme de Master en sciences informatiques à la Faculté des Sciences

CodeTypeResponsable Coordonnées
du service
Enseignant(s)
US-M1-INFO60-003-MUE optionnelleDELGRANGE OlivierS829 - Informatique théorique
  • DELGRANGE Olivier

Langue
d’enseignement
Langue
d’évaluation
HT(*) HTPE(*) HTPS(*) HR(*) HD(*) CréditsPondération Période
d’enseignement
  • Français
Français150300055.001er quadrimestre

Code(s) d’AAActivité(s) d’apprentissage (AA) HT(*) HTPE(*) HTPS(*) HR(*) HD(*) Période
d’enseignement
Pondération
S-INFO-022Algorithmique et bioinformatique1503000Q1100.00%

Unité d'enseignement
Corequis

Objectifs par rapport aux acquis d'apprentissage du programme

  • Avoir acquis des connaissances hautement spécialisées et intégrées et des compétences larges dans les diverses disciplines des sciences informatiques, qui font suite à celles relevant du niveau de bachelier en sciences informatiques
  • Réaliser des travaux de développement ou d'innovation en informatique
    • -Etre capable d'appliquer, de mobiliser, d'articuler et de valoriser les connaissances et les compétences acquises en vue de contribuer à la réalisation d'un travail de développement ou d'innovation
    • -Pouvoir maîtriser la complexité d'un tel travail et tenir compte des objectifs et des contraintes qui le caractérisent
  • Maîtriser les techniques de communication
    • -Pouvoir communiquer de façon claire, structurée et argumentée, tant à l'oral qu'à l'écrit, ses conclusions, ses propositions originales ainsi que les connaissances et principes sous-jacents
  • Développer et intégrer un grand degré d'autonomie
    • -Développer et intégrer un fort degré d'autonome pour pouvoir évoluer dans de nouveaux contextes

Acquis d'apprentissage UE

A l'issue de cet enseignement, les étudiants seront en mesure de d'expliquer les besoins de développement d'algorithmes et de structures de données performants dans le contexte de données très volumineuses telles que les séquences génétiques. Les étudiants seront en mesure d'expliquer les algorithmes classiques de bioinformatique et de string-matching. Ils seront capables de mettre en &oeuvre des algorithmes de manipulation efficaces de séquences génétiques.

Contenu de l'UE

Algorithmique; complexité d'algorithmes; chaînes de caractères; string-matching; alignements de séquences génétiques; arbres des suffixes; séquençage d'ADN et assemblage de fragments 

Compétences préalables

algorithmique; complexité d'algorithmes; programmation dans un langage impératif ou objet

Types d'évaluations Q1 pour l'UE

  • Examen oral
  • Epreuve pratique

Commentaire sur les évaluations Q1 de l'UE

Examen oral sur la partie théorique (50%) et présentation du projet développé en groupe pour la partie pratique (50%)

Calcul de la NOTE (/20) :
- Examen oral sur la partie théorique, la note NT est /20.
- Présentation et rapport écrit du projet (amélioré) développé en groupe pour la partie pratique, la note NP est /20.

Si NT>=8/20 et NP>=8/20, alors NOTE=(NP+NT)/2
Sinon NOTE=min(NP,NT)  

 

Types d'évaluation Q3 pour l'UE

  • Examen oral
  • Epreuves pratiques

Commentaire sur les évaluations Q3 de l'UE

Examen oral sur la partie théorique (50%) et présentation du projet développé en groupe pour la partie pratique (50%)

Calcul de la NOTE (/20) :
- Examen oral sur la partie théorique, la note NT est /20.
- Présentation et rapport écrit du projet (amélioré) développé en groupe pour la partie pratique, la note NP est /20.

Si NT>=8/20 et NP>=8/20, alors NOTE=(NP+NT)/2

Sinon NOTE=min(NP,NT)  

Si l'une des deux parties était réussie (note >=10) au Q1, elle n'est plus à représenter au Q3, la note est conservée.

Types d'évaluation rattrapage BAB1 (Q1) pour l'UE

  • Néant

Commentaire sur les évaluations rattr. Q1 de l'UE

Sans objet

Types d'activités

AATypes d'activités
S-INFO-022
  • Cours magistraux
  • Conférences
  • Préparations, travaux, recherches d'information

Mode d'enseignement

AAMode d'enseignement
S-INFO-022
  • Face à face

Supports principaux

AA
S-INFO-022

Supports principaux non reproductibles

AASupports principaux non reproductibles
S-INFO-022Sans objet

Supports complémentaires

AA
S-INFO-022

Supports complémentaires non reproductibles

AASupport complémentaires non reproductibles
S-INFO-022Sans objet

Autres références conseillées

AAAutres références conseillées
S-INFO-022- Introduction to Computational Molecular Biology  J. Setubal, J. Meidanis  PWS Publishing Company, 1997 - Algorithmic Aspects of Bioinformatics  HJ Böckenhauer - D. Bongartz  Springer, 2007

Reports des notes d'AA d'une année à l'autre

AAReports des notes d'AA d'une année à l'autre
S-INFO-022Autorisé
(*) HT : Heures théoriques - HTPE : Heures de travaux pratiques encadrés - HTPS : Heures de travaux pratiques supervisés - HD : Heures diverses - HR : Heures de remédiation - Dans la colonne Pér. (Période), A=Année, Q1=1er quadrimestre et Q2=2e quadrimestre
Date de dernière mise à jour de la fiche ECTS par l'enseignant : 12/05/2021
Date de dernière génération automatique de la page : 06/05/2022
20, place du Parc, B7000 Mons - Belgique
Tél: +32 (0)65 373111
Courriel: info.mons@umons.ac.be