Programme d’études | English | ||
Traitement des données biologiques | |||
Unité d’enseignement du programme de Master en biologie des organismes et écologie , à finalité approfondie à la Faculté des Sciences |
Code | Type | Responsable | Coordonnées du service | Enseignant(s) |
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US-M2-BIOEFA-015-M | UE optionnelle | GROSJEAN Philippe | S807 - Ecologie numérique des milieux aquatiques |
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Langue d’enseignement | Langue d’évaluation | HT(*) | HTPE(*) | HTPS(*) | HR(*) | HD(*) | Crédits | Pondération | Période d’enseignement |
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| Français | 0 | 10 | 0 | 0 | 0 | 2.00 | 100.00 |
Code(s) d’AA | Activité(s) d’apprentissage (AA) | HT(*) | HTPE(*) | HTPS(*) | HR(*) | HD(*) | Période d’enseignement | Pondération |
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S-BIOG-077 | Traitement des données biologiques | 0 | 10 | 0 | 0 | 0 | Q1 | 100.00% |
Unité d'enseignement |
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Objectifs par rapport aux acquis d'apprentissage du programme
Acquis d'apprentissage UE
Perfectionner les étudiants biologistes dans le traitement des données biologiques en les initiant à des notions complémentaires aux biostatistiques. Ce cours complète les notions de biostatistique vues jusqu'ici par divers topics plus avancés qui ne sont normalement pas abordés dans le cadre de tels cours: problèmes liés à la précision de calcul des ordinateurs, meilleur encodage des données selon le problème posé, comment effectuer des analyses parfaitement reproductibles, générateur de nombres pseudo-aléatoires reproductibles, pré-tri des données à l'aide de commandes SQL. Ce cours est modulable partiellement en fonction de besoins spécifiques des étudiants.
Contenu de l'UE
Gestion des données; bases de données; requêtes SQL; language S (logiciel R); calcul en virgule flottante; génération de nombre pseudo-aléatoires; analyse reproductible; tests unités; format des données; optimisation du temps de calcul; optimisation de l'utilisation de la mémoire vive; algorithmes vectorisés.
Compétences préalables
Biostatistiques avancées.
Types d'évaluations Q1 pour l'UE
Commentaire sur les évaluations Q1 de l'UE
Evaluation sur base de questions/réponses à l'examen oral.
Types d'évaluations Q2 pour l'UE
Commentaire sur les évaluations Q2 de l'UE
Evaluation sur base de questions/réponses à l'examen oral.
Types d'évaluation Q3 pour l'UE
Commentaire sur les évaluations Q3 de l'UE
Evaluation sur base de questions/réponses à l'examen oral.
Types d'évaluation rattrapage BAB1 (Q1) pour l'UE
Commentaire sur les évaluations rattr. Q1 de l'UE
Evaluation sur base de questions/réponses à l'examen oral.
Types d'activités
AA | Types d'activités |
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S-BIOG-077 |
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Mode d'enseignement
AA | Mode d'enseignement |
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S-BIOG-077 |
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Supports principaux
AA | |
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S-BIOG-077 |
Supports principaux non reproductibles
AA | Supports principaux non reproductibles |
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S-BIOG-077 | Chambers, J.M., 2008. Software for data analysis. Programming with R. Springer, New York, 498pp. |
Supports complémentaires
AA | |
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S-BIOG-077 |
Supports complémentaires non reproductibles
AA | Support complémentaires non reproductibles |
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S-BIOG-077 | Chambers, J.M., 1998. Programming with data. A guide to the S language. Springer, New York, 469pp. Fortner, B., 1995. The data handbook. A guide to understanding the organization and visualization of technical data. Springer, New York, 350pp. Venables, W.N. & B.D. Ripley, 2000. Programming with R. Springer, New York, 264pp. Venables, W.N. & B.D. Ripley, 2000. Modern applied statistics with S-PLUS (3rd ed.). Springer, New York, 501pp. |
Autres références conseillées
AA | Autres références conseillées |
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S-BIOG-077 | Sans objet |
Reports des notes d'AA d'une année à l'autre
AA | Reports des notes d'AA d'une année à l'autre |
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S-BIOG-077 | Autorisé |